Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms