Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL13O43927 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL13O43927 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms