Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALUO43852 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALUO43852 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms