Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA2O43364 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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