Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRTO14522 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRTO14522 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRTO14522 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRTO14522 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRTO14522 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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