Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms