Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VGLL3A8MV65 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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