Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms