Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms