Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KPZ7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U3KPZ7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms