Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K4Q9Y6R4 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms