Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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