Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms