Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GDE1Q9NZC3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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