Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms