Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms