Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP110Q9HB58 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms