Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms