Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

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Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP400Q96L91 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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EP400Q96L91 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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EP400Q96L91 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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EP400Q96L91 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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EP400Q96L91 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EP400Q96L91 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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