Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 POP1-202ENST00000401707 4719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 MYOZ3-201ENST00000297130 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PRAC1Q96KF2 TRPV5-201ENST00000265310 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms