Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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