Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BORCS6Q96GS4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms