Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLIP3Q96DZ5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLIP3Q96DZ5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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