Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCSTNQ92542 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms