Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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