Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms