Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms