Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms