Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM208BQ5VWN6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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