Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms