Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms