Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms