Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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