Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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