Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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