Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED1Q15648 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED1Q15648 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED1Q15648 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED1Q15648 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED1Q15648 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED1Q15648 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED1Q15648 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms