Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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UBE3CQ15386 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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