Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEA1Q15075 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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