Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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