Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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