Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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