Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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