Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms