Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CUL4AQ13619 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CUL4AQ13619 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CUL4AQ13619 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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