Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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