Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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ARHGEF5Q12774 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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ARHGEF5Q12774 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF5Q12774 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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