Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms