Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms