Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms