Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TFF3Q07654 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms